AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー

最先端ゲノム研究に、新たな選択肢。
シングルセル全ゲノム解析ソリューション、
AGM™試薬キット新登場。

AGM(アガロースゲル・マイクロカプセル)は、アガロースゲルのシェルによる、シングルセルの包埋技術です。"AGM™試薬キット" は、当技術を簡便に利用できるよう試薬キット化したものです。一般的な生物系ラボにある理化学機器を利用するだけで、微生物シングルセルを微細なAGMに包埋することが可能です。

AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー

※理化学研究所の特許技術(特許第7018685号)

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AGM™(アガロースゲル・マイクロカプセル)試薬キットのご紹介|ワン・テクノロジーズ・カンパニー

AGM™試薬キットとは?

国立研究開発法人理化学研究所の特許技術(特許第 7018685 号)を簡便に利用できる「AGM™試薬キット」を製品化いたしました。
これまでの1細胞包埋技術における課題やAGM試薬キットを利用したメリット、動物細胞への応用などについて解説しています。

AGM™試薬キットの
3つの特徴

少ない必要サンプル量

サンプルが少量であっても全ゲノム解析が可能なため、難培養性微生物の解析にも適用可能です。

高いゲノムカバー率

かつてない高いゲノムカバー率でのDNA増幅が可能。シングルセルを微小中空カプセルへ包埋することで、増幅バイアスを極限まで抑えます。これにより、かつてない高いゲノムカバー率でのDNA増幅を実現します。

安価・簡便

高価な専用機器は不要。既存のラボ設備ですぐに実験可能です。

AGMでの
ゲノムDNA増幅

個々のゲノム情報をシングルセル(単一細胞)レベルで詳細に解読する「シングルセル全ゲノム解析」は、「メタゲノム解析」との情報補完性の高さから注目されつつあります。
微生物のシングルセル全ゲノム解析の実現は極めて困難ですが、その原因は、DNAの量が絶対的に少ないという事実にあります。ゲノム解析には必要な量までDNAを増幅させる必要がありますが、その際、ゲノムの部位による増幅率の偏りが生じるため、全ゲノム解析が困難になります。この増幅バイアス問題をなくし、ゲノムカバー率を100%に近づけることが、シングルセル全ゲノム解析における重要な課題です。
シングルセル全ゲノム解析での増幅バイアスの発生を抑える方法としては、反応容積の微小化が有効であることが知られていますが、それを高いレベルで実現したのがAGM(アガロースゲル・マイクロカプセル)です。

大腸菌シングルセルからの
MDA反応によるDNA増幅

大腸菌シングルセルからのMDA反応によるDNA増幅|AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー

AGMに包埋された大腸菌シングルセル|AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー

AGMに包埋された大腸菌シングルセル
(緑色)

AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー

AGM内でMDA反応後に増幅したDNA|AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー

AGM内でMDA反応後に増幅したDNA
(緑色)

AGMでの
ゲノムカバー率

AGMはピコリットルスケールの微小中空カプセルへシングルセルを包埋することで、増幅バイアスを極限まで抑制します。実際に従来法とAGMを比較検討した大腸菌の例では、90%以上のゲノムカバー率を実現。従来法が抱える課題を解決しています。

従来法 FACS**によりPCRプレートに細胞を単離後、MDA反応実施
AGM AGMに細胞を包埋した状態でMDA反応実施

* FACS:蛍光活性化セルソーター。蛍光標識した細胞を流し、蛍光特性に基づき不均一なサンプル中から特定の細胞集団を容器へ振り分けることができる装置。

**MDA:Multiple Displacement Amplification。Phi29 DNAポリメラーゼとランダムプライマーを用い、相補鎖の置換反応が複数箇所連続して多重に起こる等温DNA増幅法。

MDA**によるDNA増幅におけるゲノムカバー率の比較結果〈大腸菌〉

MDA**によるDNA増幅におけるゲノムカバー率の比較結果〈大腸菌〉|AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー

シングルセル包埋技術比較

MEMS技術を応用したマイクロ容器や、マイクロ流路によるオイル中の微小液滴などの微小化技術では、充分なゲノムカバー率を確保できません。さらに、高価な専用機器が必要、手間がかかる、反応後のサンプル抽出が困難など、コスト、効率の両面で課題が明確でした。AGM™試薬キットは、高価な専用機器が不要です。生物系ラボにある一般的な理化学機器だけで、高いゲノムカバー率での解析実現をサポートします。

AGM ゲルビーズ Water-in-Oil
ドロップレット
粒子内外の成分移動 容易 容易 困難
構造 AGM構造|AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー ゲルビーズ構造|AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー Water-in-Oilドロップレット構造|AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー
包埋物の粒子内移動 容易 困難 容易
包埋物の抽出 容易 容易 困難
MDA必要回数* 1 2 2
AGM
構造 AGM構造|AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー
粒子内外の成分移動 容易
包埋物の粒子内移動 容易
包埋物の抽出 容易
MDA必要回数* 1
ゲルビーズ
構造 ゲルビーズ構造|AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー
粒子内外の成分移動 容易
包埋物の粒子内移動 困難
包埋物の抽出 容易
MDA必要回数* 2
Water-in-Oil
ドロップレット
構造 Water-in-Oilドロップレット構造|AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー
粒子内外の成分移動 困難
包埋物の粒子内移動 容易
包埋物の抽出 困難
MDA必要回数* 2

* DNAを、解析できる量まで増幅するのに必要な、MDA反応の実施回数

「 AGM™試薬キット」紹介セミナー

セミナーアーカイブ

「 AGM™試薬キット」紹介セミナー

2023年7月13日(木)に開催した「AGM™試薬キット」開発者である青木弘良氏による製品解説セミナーをアーカイブでご視聴いただけます。

視聴する

AGM自動作製装置のご紹介

オンチップ・バイオテクノロジーズ社製「On-chip® Droplet Generator」を利用して、AGMの自動作製が可能になります。
ご興味のある方は、オンチップ・バイオテクノロジーズ社公式サイトよりご確認ください。

On-chip®Droplet Generator

On-chip®Droplet Selector

* On-chip® Droplet Generatorは、株式会社オンチップ・バイオテクノロジーズの製品です。

* On-chip® は、株式会社オンチップ・バイオテクノロジーズの商標登録です。

【写真】DGで均一サイズのAGMを
自動大量作製

On-chip Droplet Generator(DG)で作製した80 µm程度のAGMの様子をご覧いただけます。

On-chip Droplet Generator(DG)で作製した80 µm程度のAGMの様子|AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー

AGM™試薬キット

AGM™試薬キット は、AGMのテクノロジーを簡便に利用できるよう試薬キット化したものです。
一般的な生物系ラボにあるような理化学機器を利用するだけで、微生物シングルセルを微細な AGM に包埋することが可能です。

AGM™試薬キットご購入はこちらから

標準価格:130,000円(3反応)

AGM™試薬キット|AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー

標準価格:130,000円(3反応)

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AGM試薬キット™ シングルセルゲノム解析への応用例

AGM試薬キット™ シングルセルゲノム解析への応用例|AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー

試薬キット取扱説明書|AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー

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アプリケーションノート|AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー

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その他資料(検査証明書など)|AGM™試薬キット|ワン・テクノロジーズ・カンパニー

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